怀孕35天B超看不到孕囊，可能是受精卵着床晚、宫外孕等引起的。需根据不同病因进行相应的治疗。具体分析如下：

1.受精卵着床晚：如果受精卵着床比较晚，会造成受精卵在输卵管内停留的时间较长，从而出现怀孕35天B超看不到孕囊的情况。此种情况属于正常现象，不需要过度焦虑，建议在一周以后去正规的医疗机构进行B超、尿妊娠试验等检查，明确受精卵的发育情况。

2.宫外孕：若患者曾经做过输卵管植入术、输卵管疏通术等手术或者患有子宫内膜炎、盆腔炎等疾病，容易使受精卵在输卵管部位被阻挡，使受精卵不能够进入子宫内，出现宫外孕，从而导致怀孕35天B超看不到孕囊。此种情况需要进行相应治疗，可以在医生的指导下服用米非司酮片、甲氨蝶呤片等药物进行保守治疗。情况严重时，可以及早终止妊娠，避免引发输卵管阻塞、出血性休克等严重后果。